Habiba Djilani sinh ra trong một gia đình tư sản Tunisia gồm các thợ thủ bàng buôn bán thế kỷ 19 [1]. Ông nội của bà, Hadi là một Qaid nổi tiếng [2] và cha bà, Ali, là một doanh nhân chuyên về dệt may.[3] Anh trai của bà, Hedi là một doanh nhân, nhà soạn nhạc và chính trị gia.[4]

bà học tại Lycée Carnot ở Tunis, nơi bà có bằng tốt nghiệp trung học vào tháng 6 năm 1967.

Vào tháng 6 năm 1969, bà nhận được bằng đại học về khoa học tự nhiên sau đó bắt đầu nghiên cứu y học tại Trường Y khoa Tunis.

Vào tháng 10 năm 1977, bà đã vượt qua kỳ thi nội trú y khoa quốc gia và được chỉ định phẫu thuật nói chung và phẫu thuật lồng ngực sau đó chuyển đến Trung tâm phẫu thuật Marie-Lannelongue ở Pháp. Luận án của bà trong y học là về Chấn thương gan.

bà trở thành trợ lý giáo sư y khoa năm 1981 và làm việc tại Khoa Phẫu thuật Tổng quát của Bệnh viện Charles-Nicolle ở Tunis, là một phần của nhóm của Giáo sư Ennabli, sau đó trong khoa phẫu thuật tim ở Bệnh viện Abderrahmen-Mami.[5]